بعد طلبات من عدة متبرعين مهتمين بإعطاء زكاة الفطر للاجئين والنازحين داخلياً، تواصلت المفوضية مع مجمع البحوث الإسلامية بالأزهر الشريف في أبريل 2021 للاستفتاء حول جواز توزيع زكاة الفطر نقداً للمستحقين من اللاجئين والنازحين داخلياً. وذلك بتوزيع 100% من الأماول المستلمة مباشرة للمستحقين.